第二次青藏科考云南大學張志剛團隊聯合發布青藏高原動物微生物資源庫
近日,由云南大學云南生物資源保護與利用國家重點實驗室張志剛團隊聯合國家基因庫共同開發的“青藏高原動物微生物資源庫”正式上線,訪問地址:https://db.cngb.org/qtp/。
青藏高原被稱為“世界第三極”,具有低氧、高寒、強紫外線、食物匱乏等極端環境特征。高原特有的動物類群,比如牦牛、藏羚羊、藏野驢、高原鼢鼠、高原鼠兔等,經歷了長期的自然選擇,形成了獨特的基因庫,不僅包括動物宿主自身編碼的基因,還包括共生微生物編碼的數量龐大的基因庫,特別是腸道微生物組編碼的基因數量超過了宿主基因的至少150倍。以往的研究對青藏高原動物自身基因組有了系統的解析和認知,但是針對共生微生物組,特別是腸道微生物組仍缺乏全面且深入的研究。
青藏高原動物微生物組計劃已經產生了至少30Tb的動物腸道微生物宏基因組數據,借助培養組、代謝組等多組學工具以及無菌動物功能驗證,為理解物種在極端環境下適應和演化的組學機制提供全新的視角,也為腸道微生物物種和基因資源的挖掘、保護和可持續利用提供資源支撐和技術參考。
基于此,云南大學云南生物資源保護與利用國家重點實驗室張志剛團隊聯合國家基因庫共同開發“青藏高原動物微生物資源庫”,分享腸道微生物宏基因組數據、可培養菌株信息、重大項目實時進展、產業轉化進展等,以期促進對高原動物共生微生物組(特別是腸道微生物組)的系統、深入研究和應用開發。
目前,青藏高原動物微生物資源庫已上線4個項目,包含8種高原動物的基本信息及25.91TB宏基因組測序數據(均為受控數據,需申請授權)。后續將持續更新物種信息、研究進展、宏基因組數據和可培養菌株資源。“青藏高原動物微生物資源庫”的建設得到第二次青藏高原綜合科學考察研究(2019QZKK0503)等項目資助。
(“生物多樣性保護與可持續利用”任務供稿)
