第二次青藏科考云南大學(xué)張志剛團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)布青藏高原動(dòng)物微生物資源庫(kù)
近日，由云南大學(xué)云南生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張志剛團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)家基因庫(kù)共同開(kāi)發(fā)的“青藏高原動(dòng)物微生物資源庫(kù)”正式上線(xiàn)，訪(fǎng)問(wèn)地址：https://db.cngb.org/qtp/。
青藏高原被稱(chēng)為“世界第三極”，具有低氧、高寒、強(qiáng)紫外線(xiàn)、食物匱乏等極端環(huán)境特征。高原特有的動(dòng)物類(lèi)群，比如牦牛、藏羚羊、藏野驢、高原鼢鼠、高原鼠兔等，經(jīng)歷了長(zhǎng)期的自然選擇，形成了獨(dú)特的基因庫(kù)，不僅包括動(dòng)物宿主自身編碼的基因，還包括共生微生物編碼的數(shù)量龐大的基因庫(kù)，特別是腸道微生物組編碼的基因數(shù)量超過(guò)了宿主基因的至少150倍。以往的研究對(duì)青藏高原動(dòng)物自身基因組有了系統(tǒng)的解析和認(rèn)知，但是針對(duì)共生微生物組，特別是腸道微生物組仍缺乏全面且深入的研究。
青藏高原動(dòng)物微生物組計(jì)劃已經(jīng)產(chǎn)生了至少30Tb的動(dòng)物腸道微生物宏基因組數(shù)據(jù)，借助培養(yǎng)組、代謝組等多組學(xué)工具以及無(wú)菌動(dòng)物功能驗(yàn)證，為理解物種在極端環(huán)境下適應(yīng)和演化的組學(xué)機(jī)制提供全新的視角，也為腸道微生物物種和基因資源的挖掘、保護(hù)和可持續(xù)利用提供資源支撐和技術(shù)參考。
基于此，云南大學(xué)云南生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張志剛團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)家基因庫(kù)共同開(kāi)發(fā)“青藏高原動(dòng)物微生物資源庫(kù)”，分享腸道微生物宏基因組數(shù)據(jù)、可培養(yǎng)菌株信息、重大項(xiàng)目實(shí)時(shí)進(jìn)展、產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化進(jìn)展等，以期促進(jìn)對(duì)高原動(dòng)物共生微生物組（特別是腸道微生物組）的系統(tǒng)、深入研究和應(yīng)用開(kāi)發(fā)。
目前，青藏高原動(dòng)物微生物資源庫(kù)已上線(xiàn)4個(gè)項(xiàng)目，包含8種高原動(dòng)物的基本信息及25.91TB宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)（均為受控?cái)?shù)據(jù)，需申請(qǐng)授權(quán)）。后續(xù)將持續(xù)更新物種信息、研究進(jìn)展、宏基因組數(shù)據(jù)和可培養(yǎng)菌株資源。“青藏高原動(dòng)物微生物資源庫(kù)”的建設(shè)得到第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究（2019QZKK0503）等項(xiàng)目資助。
（“生物多樣性保護(hù)與可持續(xù)利用”任務(wù)供稿）